ترتبط الميكروبات الطبيعية المتنوعة بالجلد والأغشية المخاطية لكل إنسان منذ الولادة بفترة وجيزة وحتى الوفاة. يحتوي جسم الإنسان، الذي يحتوي على حوالي 1013 خلية، بشكل روتيني على حوالي 1014 بكتيريا. تشكل هذه المجموعة البكتيرية الميكروبية الطبيعية. الفلورا الميكروبية الطبيعية مستقرة نسبيًا، مع أجناس معينة تسكن مناطق مختلفة من الجسم خلال فترات معينة من حياة الفرد.<br /><br /><br /> قد تساعد الكائنات الحية الدقيقة للنباتات الطبيعية المضيف (من خلال التنافس على البيئات الدقيقة بشكل أكثر فعالية من مسببات الأمراض مثل السالمونيلا أو عن طريق إنتاج العناصر الغذائية التي يمكن أن يستخدمها المضيف)، وقد تضر بالمضيف (عن طريق التسبب في تسوس الأسنان أو الخراجات أو غيرها من الأمراض المعدية)، أو قد توجد على شكل متعايشة (تسكن العائل لفترات طويلة دون التسبب في ضرر أو فائدة يمكن اكتشافها). <br />على الرغم من أن معظم عناصر النباتات الجرثومية الطبيعية التي تعيش في جلد الإنسان، والأظافر، والعينين، والبلعوم، والأعضاء التناسلية، والجهاز الهضمي غير ضارة لدى الأفراد الأصحاء ، إلا أن هذه الكائنات تسبب المرض في كثير من الأحيان للمضيفين المعرضين للخطر. لا تعتبر الفيروسات والطفيليات أعضاء في النباتات الجرثومية الطبيعية من قبل معظم الباحثين لأنها ليست متكافئة ولا تساعد المضيف<br />