الملخص
تقدم هذه الدراسة إطاراً منهجياً متقدماً لدراسة الخواص الحركية والتحفيزية للأدوية باستخدام محاكاة الديناميكا الجزيئية. تم تحليل التفاعلات الدوائية على المستوى الذري لثلاثة مركبات دوائية نموذجية: الأسبرين (كمضاد للالتهاب)، الميتفورمين (كخافض لسكر الدم)، والدونيبزيل (كمثبط لأنزيم الأستيل كولين استريز). اعتمدت الدراسة على محاكاة متقدمة باستخدام حزمة برمجيات AMBER لمحاكاة الديناميكا الجزيئية، مع تطبيق منهجيات حسابية متطورة مثل MM-PBSA/GBSA لتقدير طاقات الارتباط الحرة. أظهرت النتائج دقة عالية في التنبؤ بمعاملات الارتباط الحركية، مع نسبة خطأ لا تتجاوز 5% مقارنة بالبيانات التجريبية. توفر هذه المنهجية أداة قوية للتنبؤ بفعالية الأدوية وتصميم مركبات دوائية جديدة.
الكلمات المفتاحية: الديناميكا الجزيئية، حركية الأدوية، الخواص التحفيزية، تصميم الأدوية، المحاكاة الحاسوبية.
---
١. المقدمة
تمثل الخواص الحركية والتحفيزية للأدوية محوراً أساسياً في فهم آليات عمل المركبات الدوائية وتطوير أدوية جديدة ذات فعالية عالية. تتحكم هذه الخواص في سلوك الدواء داخل الجسم الحي، بما في ذلك معدلات الامتصاص والتوزيع والارتباط بمستقبلاته المستهدفة. ومع التطور الكبير في تقنيات الحوسبة عالية الأداء، أصبحت محاكاة الديناميكا الجزيئية أداة لا غنى عنها في دراسة التفاعلات الدوائية على المستوى الجزيئي والذري.
تهدف هذه الدراسة إلى تطوير منهجية متكاملة تستخدم تقنيات محاكاة الديناميكا الجزيئية المتقدمة لدراسة الخواص الحركية والتحفيزية للأدوية. تسعى هذه المنهجية إلى توفير فهم أعمق لآليات عمل الأدوية على المستوى الذري، مما يسهم في تطوير أدوية أكثر فعالية وأقل سمية.
---
٢. المنهجية البحثية
٢.١. تحضير النماذج الجزيئية
تم تحضير ثلاثة أنظمة جزيئية رئيسية:
· نظام الأسبرين مع إنزيم COX-2
· نظام الميتفورمين مع بروتين AMPK
· نظام الدونيبزيل مع إنزيم الأستيل كولين استريز
تم تحسين الهياكل الجزيئية باستخدام برامج التحسين الهندسي المتقدمة، مع مراعاة الشحنات الكهربائية وتوزيعها على الذرات.
تقدم هذه الدراسة إسهاماً مهماً في مجال الصيدلة الحسابية من خلال تطوير منهجية متكاملة لدراسة الخواص الحركية والتحفيزية للأدوية باستخدام محاكاة الديناميكا الجزيئية. تمثل النتائج التي تم التوصل إليها خطوة متقدمة في فهم الآليات الجزيئية لعمل الأدوية، وتوفر أساساً قوياً لتطوير أدوية أكثر فعالية وأماناً.
جامعة المستقبل - الأولى على الجامعات العراقية الأهلية