كنيسة الأقيصر هي كنيسة تاريخية قديمة تقع في صحراء قضاء عين التمر، على بعد 70 كم جنوب غرب محافظة كربلاء العراقية، تُعد واحدة من أقدم الكنائس في العراق، حيث يعود تاريخ بنائها إلى القرن الخامس الميلادي وتتميز بوجود كتابات آرامية ورسوم مختلفة للصليب، تُشير بعض الدراسات إلى أن الكنيسة كانت مركزًا دينيًا هامًا للمسيحيين في المنطقة، الكنيسة عبارة عن بناء مستطيل الشكل، بطول 40 مترًا وعرض 8 أمتار، تتميز بوجود محراب يتجه نحو القدس وتصميمها نموذجًا للطراز البازيليكي الذي كان شائعًا في بناء الكنائس القديمة، تعاني الكنيسة حاليا من الإهمال رغم قيمتها التاريخية والدينية، اذ تعرضت لعمليات نهب وتهريب مما أدى إلى تلف بعض معالمها.